El cuerpo rector de la Universidad Interamericana de Puerto Rico es su Junta de Síndicos, cuyos miembros son elegidos libremente sin intervención de autoridad externa alguna. La Junta de Síndicos ha desempeñado un papel fundamental en el desarrollo de la Institución, formulando normas y políticas que rigen la Universidad con una visión amplia y en concordancia con la realidad de la institución y de la sociedad puertorriqueña. Los síndicos de la UIPR son destacados profesionales del mundo cívico, empresarial y académico de Puerto Rico.
Miembros de la Junta de Síndicos:
- CPA Domingo Más Rivera, Presidente
- Dr. Eliezer Álvarez Díaz,Vicepresidente
- Profa. Marcelina Vélez de Santiago, Secretaria
- Lcda. Aída N. Molinary de la Cruz, Subsecretaria
- Lcdo. Samuel Lizardi Rivera, CPA, Tesorero
- Dra. Manuelita Muñoz Rivera, Subtesorera
- Lcdo. Ramón Ayala Cuervos
- Dra. Gloria Cordero González
- Dr. Juan G. Feliciano Valera
- Lcdo. José A. Figueroa Santaella
- Ing. Jorge L. Fuentes Benejam
- Sr. Antonio R. Pavía Bibiloni
- Rvdo. Juan José Pérez Alda
- Sr. Felipe Piazza Vázquez
- Lcdo. Víctor Rivera Hernández
Síndica Emérita:
- Dra. Gloria M. Santaella de Figueroa